普城沙雷氏菌rpoS基因的生物信息学分析

• 作者: 刘晓光 郭松
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 普城沙雷氏菌 RpoS 一般胁迫反应 主控基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 485-488,492
• 页数: 5页
• 分类号: R378
• 字数: 2860字
• 语种: 中文

摘要

目的:通过生物信息学方法对普城沙雷氏菌G3菌株rpoS基因的序列、理化性质和结构进行解析,为进一步研究生物学功能提供依据.方法:利用Expasy数据库分析蛋白质的理化性质;TMHMMServerv.2.0、TargetP 1.1Server和SignalP 4.1 Server预测跨膜结构和信号肽;分别用NetNGlyc 1.0Server和NetPhos 2.0预测磷酸化、糖基化位点;用SOPMA和SWISS-MODEL分别对蛋白质二级和三级结构进行预测;用MEGA 4 NJ法构建系统进化树.结果:RpoS是一个亲水性蛋白,没有跨膜区域和信号肽,有糖基化位点和高水平的磷酸化位点,α-螺旋和无规则卷曲是其主要二级结构.结论:生物信息学预测表明RpoS具有较高比例的磷酸化位点和由α-螺旋和无规则卷曲组成的二级结构,这与其整合和响应环境中不同的胁迫信号刺激,诱导一般胁迫反应使细菌在逆境中得以生存的生物学功能相吻合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘晓光	江苏大学生命科学研究院	28	352	11.0	18.0
2	郭松	江苏大学生命科学研究院	2	0	0.0	0.0