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利用酵母双杂交系统筛选介体异沙叶蝉中与小麦矮缩病毒外壳蛋白互作的蛋白质
利用酵母双杂交系统筛选介体异沙叶蝉中与小麦矮缩病毒外壳蛋白互作的蛋白质
作者:
刘艳
王锡锋
赵艺泽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
异沙叶蝉
小麦矮缩病毒
SMART技术
cDNA文库
分离泛素酵母双杂膜系统
摘要:
【目的】利用分离泛素酵母双杂交膜系统(split-ubiquitin yeast membrane system),以小麦矮缩病毒(Wheat dwarf virus,WDV)的外壳蛋白(CP)基因为诱饵对异沙叶蝉(Psammotettix alienus L.)cDNA文库进行筛选,研究异沙叶蝉传播WDV的分子机制。【方法】以笔者实验室饲养的异沙叶蝉为材料,提取其总RNA后取100 ng进行纯化,利用SMART法反转录合成ds cDNA,经过SfiI酶切纯化,连接到pPR3-N文库载体上,构建得到以pPR3-N为载体的异沙叶蝉分离泛素酵母双杂交膜系统cDNA文库。同时,构建带有Sfi I酶切位点的诱饵载体pDHB1-WDV CP,经功能检测后用诱饵载体初步筛选pPR3-N空文库,寻找适合筛库的条件和确定His基因产物抑制剂3-氨基-1,2,4-三唑(3-AT)的使用浓度。然后用诱饵载体筛选异沙叶蝉 cDNA 文库,对筛选结果进行分析,再通过共转验证和β-半乳糖苷酶检测进一步验证是否发生互作。利用Uniprot和KEGG在线网站,对筛到的蛋白进行gene ontology(GO)注释和Pathway分析。【结果】初级文库库容量超过2.0×106cfu,文库实际扩增数量大于1.3×106cfu,文库重组率大于97%,扩增文库插入片段平均长度大于1000 bp,表明异沙叶蝉cDNA文库的质量较高。酶切验证显示诱饵载体pDHB1-WDV-CP中CP的插入完整而准确。功能检测表明融合蛋白能够正确表达。在3-AT浓度为5 mmol?L-1的筛选条件下,诱饵载体筛选异沙叶蝉cDNA文库得到280个克隆,经测序和Blast比对分析最终得到12个可能与WDV的CP发生互作的异沙叶蝉蛋白质。将这12个蛋白质再次进行共转验证和β-半乳糖苷酶检测,最终得到9个蛋白质与WDV CP互作。GO注释显示,9个蛋白参与的生物过程包括蛋白去磷酸化、碳水化合物代谢过程、先天性免疫应答、模式识别受体的信号通路、运输、同向运输和乙醇氧化等;分子功能包括金属离子结合活性、蛋白磷酸酶活性、信号模式识别受体的活性、水解酶活性、磷酸离子载体活性和叶酸运输活性等。参考KEGG数据库,这些蛋白参与的代谢途径有泛素介导的蛋白水解途径、内吞作用、花生四烯酸代谢途径、cAMP 信号通路和模式识别受体的信号通路等。【结论】异沙叶蝉分离泛素酵母双杂交膜系统cDNA文库的成功构建与筛选,为研究异沙叶蝉与小麦矮缩病毒的互作机制研究奠定了基础。
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篇名
利用酵母双杂交系统筛选介体异沙叶蝉中与小麦矮缩病毒外壳蛋白互作的蛋白质
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
异沙叶蝉
小麦矮缩病毒
SMART技术
cDNA文库
分离泛素酵母双杂膜系统
年,卷(期)
2015,(12)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
2354-2363
页数
10页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2015.12.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王锡锋
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
44
383
12.0
17.0
2
刘艳
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
38
249
9.0
14.0
3
赵艺泽
中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室
1
9
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传播情况
被引次数趋势
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二级引证文献(0)
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引证文献(3)
二级引证文献(0)
2018(5)
引证文献(2)
二级引证文献(3)
2019(6)
引证文献(4)
二级引证文献(2)
2020(2)
引证文献(0)
二级引证文献(2)
研究主题发展历程
节点文献
异沙叶蝉
小麦矮缩病毒
SMART技术
cDNA文库
分离泛素酵母双杂膜系统
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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