西藏牦牛ATGL基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 宋乔乔 廖珂 张思源 杨琴 柴志欣 钟金城 陈攀攀
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 西藏牦牛 ATGL基因 克隆测序 同源性比对 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 39-44,228
• 页数: 7页
• 分类号: S823.8+5|Q785
• 语种: 中文

摘要

为了研究西藏牦牛ATGL基因的理化特性及分子结构,试验采用PCR扩增和DNA测序技术以及生物信息学分析软件对西藏类乌齐牦牛ATGL基因进行克隆测序和生物信息学分析.结果表明:西藏类鸟齐牦牛ATGL基因编码区全长为l 461 bp,可编码486个氨基酸,其中A、T、G、C碱基含量分别为17.2％、17.9％ 29.0％、35.9％,A+T为35.1％,G+C为64.9％;相对分子质量为53 417.9,理论等电点为6.83,在构成该蛋白所编码的氨基酸中亮氨酸(Leu)和脯氨酸(Pro)的含量最高,分别为13.4％和9.5％,总的带正电(Arg+ Lys)和负电(Asp+Glu)残基分别为46和47;西藏类乌齐牦牛ATGL基因编码区核苷酸序列与普通牛、野猪、人、绵羊、山羊、绿头鸭、原鸡、小家鼠的核酸序列一致性分别为99.58％、87.52％、87.78％、96.26％、95.93％、67.63％、64.44％、82.65％;西藏类乌齐牦牛ATGL基因编码氨基酸序列与普通牛、野猪、人、绵羊、山羊、绿头鸭、原鸡、小家鼠的氨基酸序列一致性分别为99.79％、87.45％、87.66％、95.06％、96.09％、73.14％、69.56％、87.53％;AT-GL蛋白为不稳定的跨膜蛋白,无信号肽;其二级结构主要以α-螺旋、β-折叠以及无规卷曲为主,其中94个氨基酸残基参与了16个α-螺旋的形成(占39.11％),35个氨基酸残基参与了9个β-折叠的形成;在三级结构中,其N端存在1个Patatin结构域.说明西藏牦牛ATGL基因在编码区序列存在明显的碱基偏倚性,在进化关系上ATGL基因无论核苷酸序列还是氨基酸序列都有较高的保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟金城		92	727	16.0	22.0
2	柴志欣		22	45	4.0	6.0
3	张思源		3	2	1.0	1.0
4	陈攀攀		2	0	0.0	0.0
5	宋乔乔		3	0	0.0	0.0
6	杨琴		3	0	0.0	0.0
7	廖珂		1	0	0.0	0.0