绵羊IGFBP-5基因的克隆及序列分析

• 作者: 吴登俊 周明亮 张翔宇 杨平贵
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: IGFBP-5 克隆 基因 绵羊 蛋白质 序列
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 14-17,21,235-236
• 页数: 1页
• 分类号: S826|Q785
• 语种: 中文

摘要

为了克隆IGFBP-5基因的CDS序列及其生物信息学分析,试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了IGFBP-5基因的CDS全序列,并用生物信息学方法深入分析其序列.结果表明:IGFBP-5基因的CDS序列为816 bp,编码271个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为97％、94％、89％,氨基酸序列同源性分别为98％、98％、95％,GenBank登录号为EU727460.1;IG-FBP-5基因的氨基酸分子质量为30.3 ku,理论等电点(pI)为8.56;进化分析显示与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与蟾、鱼类等亲缘关系较远;IGFBP-5基因存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、22个磷酸化位点、2个N-糖基化位点和3个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为66.42％、22.51％、11.07％;三级结构分析显示存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域.