华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白基因的生物信息学分析

• 作者: 周晨慧 徐道华 李珊 汪肖云 陈文君
• 来源期刊: 现代医药卫生
• 关键词: 华支睾吸虫病 硫氧还蛋白质类 膜蛋白质类 基因 计算生物学
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 论 著
• 页码范围: 969-971
• 页数: 3页
• 字数: 2385字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5519.2015.07.005

摘要

目的：对华支睾吸虫硫氧还蛋白跨膜蛋白（CsTMX）基因进行生物信息学分析。方法利用生物信息学方法（InterProScan、SignalP、TMHMM和SWISS—MODEL等相关软件）对CsTMX基因及相应氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、信号肽、亲水性/疏水性、三级结构进行预测分析。结果 CsTMX基因的开放阅读框（ORF）包含414 bp，编码137个氨基酸，理论分子质量为16.04×103，等电点为5.16。TMHMM和SignalP3.0分析结果显示CsTMX含信号肽，其在第19~20位氨基酸之间有1个切割位点；InterProScan和SWISS—MODEL分析结果显示，TMX特征性结构域位于第21~27位氨基酸之间，并且具有高度保守的CPAC基因序列。结论利用生物信息学知识和各种分析软件对CsTMX所编码的cDNA序列及理论蛋白质的理化性质、结构和功能域等进行预测和分析，能够为开展CsTMX的表达及其功能研究提供理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐道华	广东医学院护理学院	25	179	8.0	12.0
2	周晨慧	广东医学院护理学院	25	180	6.0	12.0
3	汪肖云	广东医学院护理学院	1	1	1.0	1.0
4	陈文君	广东医学院护理学院	1	1	1.0	1.0
5	李珊	广东医学院护理学院	1	1	1.0	1.0