基于ChIP-seq测序数据的二维快速检索技术

• 作者: 周家蓬 宋新蕊 李达 赵勇 金容霞
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: ChIP-seq Hilbert曲线 图像检索 感知哈希算法 颜色直方图 颜色相关图
• 年，卷（期）: 2015,（13）
• 所属期刊栏目: 荫医学信息学 -- 临床医学信息学
• 页码范围: 2-3
• 页数: 2页
• 分类号: R857.3
• 字数: 2438字
• 语种: 中文

摘要

ChIP-seq技术是研究全基因组范围内转录因子结合位点的重要技术。ChIP-seq测序数据晦涩难懂，2009年Simon Anders发明了Hilbert曲线方法，将一维测序数据以二维图像形式呈现。本文在前人工作基础上，研究使用三种图像相似性检索的技术，对测序数据进行快速检索。通过模拟数据测试，证明了图像相似性检索方法在操作性和计算速度方面比传统的序列比对(Blast)检索技术有显著优势。本研究对高通量测序数据的医学诊断或有裨益。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵勇		4	13	2.0	3.0
2	宋新蕊		4	13	2.0	3.0
3	周家蓬		5	33	2.0	5.0
4	李达		3	10	1.0	3.0
5	金容霞		1	0	0.0	0.0