猫杯状病毒的分离鉴定及其全基因组的序列分析

• 作者: 何剑桥 何平 周华波 李法凯 李瑞凯 杨文娟 梁明丽 祝健 赵卫锋 陈樱 韦祖樟 韦红云 黄伟坚
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猫杯状病毒 全基因组 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文 -- 病毒
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3689字
• 语种: 中文

摘要

本研究采用MDCK细胞从养殖场患病猪的鼻拭子样品中分离获得1株猫的杯状病毒（Feline calicivirus，FCV），命名为GX01-2013。采用RT-PCR方法扩增了该毒株的全基因组，并进行了序列测定和分析。结果表明，该毒株基因组全长7704 bp，与哈尔滨分离株HRB-SS较为相近，其核苷酸同源性为82.3%。根据FCV衣壳蛋白构建的遗传进化树分析，发现该病毒与F9、F4、225和2024疫苗株均不在同一分支，氨基酸同源性为84.2%~87.7%，各毒株间无明显地域差异。此外，VP1蛋白的E区（426~521aa）发现有4个中和性抗原位点发生改变。