新发虫媒病毒：基因A型版纳病毒全基因组序列扩增引物

• 作者: 刘红 梁国栋
• 来源期刊: 媒介
• 学科: 医学
• 关键词: 版纳病毒 基因型 测序
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 533-538
• 页数: 6页
• 分类号: R373.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2016.06.002

摘要

目的：设计版纳病毒型别特异性测序引物，为构建快速高效经济的版纳病毒全基因组测序平台奠定基础。方法根据GenBank已知的版纳病毒基因序列信息进行基因型分析，采用Primer Premier v6.0及Oligo 7.56软件完成版纳病毒亚型特异性扩增引物的设计与评估。使用中国分离的30株版纳病毒进行版纳病毒型别特异性引物工作效率验证和评估。结果通过对30株隶属于2个不同基因亚型的版纳病毒开展全基因组序列测定，获得2套型别工作效率高、扩增效果稳定的基因A型特异性版纳病毒全基因组序列扩增测序引物。基因A1亚型引物一套共26对；基因A2亚型引物一套共计30对。完成了30株版纳病毒全基因组序列扩增。结论设计的版纳病毒型别特异性扩增测序引物可以高效准确地完成版纳病毒全基因组序列扩增，为进一步深入研究版纳病毒分子生物学特征奠定了基础。