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摘要:
基于对β-发夹模体的预测探索,本文使用随机森林和支持向量机两种算法,对ArchDB40数据库及自建数据集中的β-发夹模体进行预测.对于同一数据集,在特征参数和检验方法均相同的情况下,随机森林算法的预测精度要高于支持向量机算法.此外,由于随机森林算法在参数维数较高的情况下不会发生过拟合现象,所以本文采用了将高维特征参数输入随机森林算法的方法来预测β-发夹,得到了较好的预测效果:对ArchDB40数据库中的β-发夹进行预测,其5-交叉检验的预测精度和相关系数分别是83.3%和0.59;对自建数据集中的β-发夹进行预测,其5-交叉检验的预测精度和相关系数分别是85.2%和0.62.
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文献信息
篇名 随机森林和支持向量机算法在β-发夹模体预测中的比较
来源期刊 温州大学学报(自然科学版) 学科 工学
关键词 随机森林算法 支持向量机算法 β-发夹模体 离散增量 预测的二级结构信息
年,卷(期) 2016,(3) 所属期刊栏目 数学
研究方向 页码范围 26-33
页数 8页 分类号 TP181
字数 3971字 语种 中文
DOI 10.3875/j.issn.1674-3563.2016.03.005
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作者信息
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1 贾少春 忻州师范学院数学系 2 2 1.0 1.0
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随机森林算法
支持向量机算法
β-发夹模体
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