基于蛋白组学和代谢组学技术解析腐败希瓦氏菌净化水产品加工废水的生物学机制

• 作者: 何伟娜 周君 张迪骏 王中华 苏秀榕 陈丽萍
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 腐败希瓦氏菌 蛋白组学 代谢组学 实时荧光定量PCR 水产加工废水
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 食品安全与检测
• 页码范围: 136-146
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2016.05.020

摘要

目的:利用蛋白组学、代谢组学和实时荧光定量PCR技术研究腐败希瓦氏菌净化水产品加工废水的生物学机制,挖掘相关功能蛋白,为食品加工废水治理提供理论依据.方法:以淡水培养为对照,宁波象山石浦水产品加工园区排污口处废水培养为试验组,应用双向电泳(2-DE)技术筛选2种培养的腐败希瓦氏菌功能蛋白;利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术验证基因表达情况;核磁共振(NMR)技术鉴定菌体胞内代谢产物.结果:双向电泳筛选出31个差异蛋白,表达差异1.5倍以上的蛋白22个,最大差异比率为12.1.采用MALDI-TOF-MS-MS技术进行蛋白定性,GO和KEGG分析,其差异蛋白涉及铁代谢、ABC转运系统、抗生素合成、硫代谢、谷胱甘肽合成等.选取11个基因进行qRT-PCR,7个基因与蛋白表达水平一致,4个基因呈现负相关.NMR检出10类59种胞内代谢产物,其中腐胺、乙酸盐等8种代谢物的表达差异较大.结论:与净化水产品加工废水相关的功能蛋白2个,即半胱氨酸合酶和异柠檬酸脱氢酶.这两种酶在降解无机硫、重金属解毒、清除自由基,抵御氧化性损伤等方面发挥关键的作用,有望将其应用于废水治理.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏秀榕	宁波大学海洋学院	233	2778	25.0	38.0
2	周君	宁波大学海洋学院	62	308	9.0	13.0
3	王中华	宁波大学海洋学院	17	101	6.0	9.0
4	张迪骏	宁波大学海洋学院	20	130	7.0	10.0
5	陈丽萍	宁波大学海洋学院	8	69	5.0	8.0
6	何伟娜	宁波大学海洋学院	4	34	3.0	4.0