龙眼生长素受体基因TIR1的克隆及其与miR393互作关系

• 作者: 林玉玲 赖瑞联 赖钟雄
• 来源期刊: 应用与环境生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 体胚发生 生长素受体 启动子 miR393 激素 定量PCR
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 95-102
• 页数: 8页
• 分类号: S667.203|Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1145.2015.05051

摘要

为了解龙眼生长素受体基因TIR1的功能,以龙眼胚性愈伤组织为材料,在转录水平上对TIR1(命名为DlTIR1-3)及其启动子进行克隆和分析,并在转录后水平上研究TIR1与miR393的相互调控关系.结果表明,DlTIR1-3 cDNA全长2196 bp,包含ORF 1 716 bp,编码571个氨基酸(GenBank登录号:KR558761);生物信息学分析发现,D1TIR1-3属于不稳定蛋白,不含有信号肽,含有跨膜螺旋结构,具有F-box保守结构域和富含异亮氨酸重复结构,且D1TIR1-3与碧桃TIR1保持较高的同源性.染色体步移法克隆获得DlTIR1-3启动子序列2909 bp(GenBank登录号:KR558763),该启动子不存在CpG岛但含有大量光反应、激素应答、组织特异性调控、胁迫响应以及其他生长发育相关的作用元件.psRNAtarget 结合改良RLM-RACE验证表明miR393能够裂解DlTIR1-3从而抑制其mRNA转录;qPCR结果显示,DlTIR1-3与miR393相互平衡能够调节龙眼体胚形态建成及响应激素调控.由此可见,DlTIR1-3通过转录水平的调控作用在龙眼生长发育、激素应答、组织分化及胁迫响应等过程中发挥重要功能,而在转录后水平上miR393通过裂解DlTIR1-3参与相关调控过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄		473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲		148	560	10.0	16.0
3	赖瑞联		15	82	5.0	8.0