大豆GmST1基因的生物信息学分析

• 作者: 井妍 孙晶 李文滨 滕卫丽 赵雪 韩英鹏 高赛男
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 GmST1 磺基转移酶 蛋白质结构分析 功能预测
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 394-401
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2016.03.0394

摘要

磺基转移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一个基因超家族.对大豆磺基转移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)进行基于生物信息学的基因结构分析与功能预测,结果表明:GmST1(Williams82)基因序列全长1 439 bp,CDS区长1 035 bp,编码344个氨基酸.通过序列比对,分析出在感病Williams 82和抗病品种东农93-046中,GmST1序列存在着非同义SNP,导致氨基酸改变.利用PlantCARE分析启动子元件,发现在基因启动子序列中含有多个与光诱导、生长素、水杨酸、干旱等相关的元件.在BAR数据库中分析了GmST1的拟南芥同源基因在不同逆境胁迫条件下基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、干旱胁迫和抗病等相关反应.