核盘菌磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶编码基因的预测与生物信息学分析

• 作者: 吴亚 张茜茹 李秀丽 樊淼 高智谋
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 核盘菌 磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 359-365
• 分类号: Q949.32|Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20160512.012

摘要

为了解磷酸泛酰巯基乙胺基转移酶(PPTases)在核盘菌生理代谢与致病过程中的作用,在核盘菌全基因组中寻找PPTases同源物.利用同源比对的方法,预测出核盘茵中PPTases基因,进而分析其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、二级、三级结构和保守结构域,并对PPTases编码氨基酸进行遗传进化分析.结果表明,在核盘菌全基因组中预测存在3个PPTases基因同源物,分别命名为:Ss-Ppt1、Ss-Ppt2和Ss-Ppt3.3个蛋白均为亲水性的非分泌型蛋白,在其二级和三级结构中α螺旋结构和无规则卷曲占主要部分,且三者都含有PPTases的保守结构域SCOP和(或)ACPS.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高智谋	安徽农业大学植物保护学院	117	1437	21.0	30.0
2	李秀丽	安徽农业大学植物保护学院	3	9	2.0	3.0
6	樊淼	安徽农业大学植物保护学院	3	8	1.0	2.0
7	吴亚	安徽农业大学植物保护学院	3	6	1.0	2.0
8	张茜茹	安徽农业大学植物保护学院	4	7	1.0	2.0