川山茶ISSR-PCR及SSR-PCR优化体系建立及比较

• 作者: 刘家艳 卢娟芳 权俊萍 沈薛洁 田波 陈启航
• 来源期刊: 江苏林业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 川山茶 ISSR-PCR SSR-PCR 引物 退火温度 TaqDNA聚合酶 正交设计 优化体系
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S685.14
• 字数: 4447字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-7380.2016.05.001

摘要

以川山茶品种“茶睡莲”为试验材料,以改良CTAB法提取高质量DNA,采用正交设计L16(45),探讨了Mg2+、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶和模板DNA浓度对川山茶ISSR-PCR和SSR-PCR反应体系的影响.建立了相关优化体系:20 μL的ISSR-PCR扩增体系中含20 ng模板DNA,2L10× Buffer,2 mmol/L Mg2+,0.15 mmol/L dNTPs,0.6μmol/L引物和1 U TaqDNA聚合酶,扩增退火温度为55℃,35个循环;20 μL的SSR-PCR扩增体系中含50 ng模板DNA,2.5 mmol/LMg2+,0.05 mmol/L dNTPs,0.2μmol/L引物和0.5 U TaqDNA聚合酶,最佳退火温度为52℃,最佳循环数为38.应用该优化体系,分别用27个川山茶品种DNA进行了ISSR-PCR扩增和SSR-PCR扩增,结果显示,建立的优化体系具有较高稳定性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田波		2	3	1.0	1.0
2	卢娟芳	西南大学园艺园林学院	5	27	3.0	5.0
3	刘家艳		4	21	3.0	4.0
4	权俊萍		3	3	1.0	1.0
5	沈薛洁		1	3	1.0	1.0
6	陈启航		1	3	1.0	1.0