毛竹 TIPs 基因家族成员组织表达模式研究

• 作者: 娄永峰 孙化雨 李利超 赵韩生 高志民
• 来源期刊: 林业科学研究
• 关键词: 毛竹 液泡膜内在水通道蛋白 表达分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 521-528
• 页数: 8页
• 分类号: S795.7
• 语种: 中文

摘要

[目的]通过研究毛竹 TIPs 的分子特征和表达模式，为揭示逆境胁迫条件下 TIPs 在竹子中的作用提供证据，为培育抗逆的植物新品种提供新的基因资源。[方法]以毛竹为对象，利用生物信息学方法对毛竹基因组中的 TIPs基因进行了全面分析，采用实时荧光定量 PCR 技术分析基因在不同组织及干旱、水淹和 NaCl 胁迫下的表达模式。[结果]毛竹基因组中含有6个 TIPs 同源基因，分别隶属于3个亚类（TIP1、TIP2和 TIP4）。基因结构预测显示， PeTIP1；1、PeTIP1；2、PeTIP2；2和 PeTIP4；2由2个外显子和1个内含子组成，而 PeTIP2；1和 PeTIP4；1由3个外显子和2个内含子组成。蛋白结构分析显示，毛竹6个 TIPs 均具有2个典型的 NPA 结构域和4个 ar／R 模体。通过转录组数据分析基因的组织表达特异性，结果表明 PeTIP1；1在各组织中的表达丰度均较高；PeTIP1；2主要在花中表达；PeTIP2；1在根和鞭中表达量较高；PeTIP2；2在根中特异表达；PeTIP4；1在叶片中表达丰度最高；PeTIP4；2在笋和鞭中表达水平较高，在根中最低。实时定量 PCR 结果分析证明，干旱处理后毛竹根中 PeTIP4；1的表达量显著升高（p ＜0．01），PeTIP2；1、PeTIP2；2和 PeTIP4；2表达受到抑制（p ＜0．01）；水淹处理后根中 PeTIP1；1和 PeTIP4；1表达量显著增加（p ＜0．01），PeTIP1；2、PeTIP2；2、和 PeTIP4；2则显著降低（p ＜0．01）；NaCl 处理后根中6个 PeTIPs的表达量均显著增加（p ＜0．01）。干旱处理后毛竹叶片中 PeTIP1；1、PeTIP1；2和 PeTIP4；1表达量均显著增加（p ＜0．01）；水淹处理后叶片中 PeTIPs 表达量均显著提高（p ＜0．01）；NaCl 处理后叶片中 PeTIP2；1表达受到明显抑制（p＜0．01）。[结论]PeTIPs 可能在毛竹抵抗干旱、水淹和 NaCl 等非生物胁迫中发挥着不同程度的作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高志民	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	76	679	15.0	21.0
2	赵韩生	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	31	135	6.0	9.0
3	娄永峰	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	16	86	6.0	8.0
4	孙化雨	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	21	88	6.0	8.0
5	李利超	国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室	13	32	4.0	4.0