葡萄SnRK2家族基因的鉴定与表达分析

• 作者: 吴金红 李文芳 杨世茂 毛娟 陈佰鸿 马宗桓
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 SnRK2家族 基因克隆 荧光定量 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 1891-1902
• 分类号: S663.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0912

摘要

以‘宝石无核’(Ruby Seedless)葡萄试管苗为材料,采用RT-PCR技术,克隆得到8个葡萄SnRK2家族基因.序列分析发现,该家族基因蛋白结构在N端相对保守,而在C端极其特异;聚类结果表明葡萄SnRK2基因家族可以分为3个亚家族;对这8个基因所编码的蛋白质进行分析发现,其富含酸性氨基酸,且均为亲水蛋白;基因组结构分析发现VvSnRK2.2和VvSnRK2.8含有10个外显子,其他6个均含9个外显子;对蛋白二级结构分析发现8个基因编码的蛋白主要以α-螺旋、β-转角和不规则卷曲为主;亚细胞定位预测,8个基因主要定位于细胞质中.顺式作用元件分析表明,除VvSnRK2.1、VvSnRK2.2、VvSnRK2.6外,其他基因顺式作用元件包含ABRE、DRE/CRT、LRTE中的一个或多个.定量PCR分析表明,VvSnRK2的表达存在组织差异性,VvSnRK2.7在根中表达水平最高,是叶片的3.8倍,VvSnRK2.8在茎中表达水平最高,是叶片的5.0倍.0～-4℃处理后,表达水平下调幅度最小的为VvSnRK2.2,VvSnRK2.7下调幅度较大,VvSnRK2.8的表达水平为0;30℃处理后VvSnRK2.2和VvSnRK2.5上调表达,分别为对照的3.8倍和3.6倍;VvSnRK2.1和VvSnRK2.2与盐胁迫调节紧密相关,VvSnRK2.5与干旱胁迫调节密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佰鸿	甘肃农业大学园艺学院	128	886	13.0	25.0
2	毛娟	甘肃农业大学园艺学院	91	429	10.0	18.0
3	李文芳	甘肃农业大学园艺学院	13	25	3.0	4.0
4	马宗桓	甘肃农业大学园艺学院	28	47	4.0	5.0
5	杨世茂	甘肃农业大学园艺学院	2	10	1.0	2.0
6	吴金红	甘肃农业大学园艺学院	2	9	1.0	2.0