大豆中介体亚基基因鉴定及表达特性分析

• 作者: 李海朝 李金英 武永康 王丰青 练云 雷晨芳 魏荷
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 中介体亚基 鉴定 序列分析 表达特性
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 31-38
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2016.01.0031

摘要

中介体复合物在真核生物蛋白编码基因和非编码RNA的转录中非常重要.为了分析大豆中介体亚基的序列特征和基因表达模式,应用BLASTp获取与拟南芥中介体亚基同源的蛋白序列,用Clustal Omega、MAFFT、MEGA等方法进行多序列联配和进化分析,同时应用MeV构建了基因的表达量热图.结果表明:共获得118个基因位点(Locus),186个转录本,在大豆20条染色体上均有分布.Med8的N端具有TBP结构域,Med31的C端具有脯氨酸富集区和假定的核定位信号,Med16的C端有C2-C2型锌指结构域(Zinc-finger motif).栽培大豆与野生大豆的同源蛋白亲缘关系最近,进化分析符合物种进化规律.大豆不同中介体亚基基因的表达量差异很大,但同一基因在不同组织中的表达差异较小,仅有3个基因在根瘤中特异表达,1个基因在豆荚中特异表达.脱水处理后5个中介体亚基基因表达上调明显,NaC1处理1和6h后分别有2和3个中介体亚基基因表达显著上调.这为进一步分析中介体亚基在大豆发育和逆境胁迫中的分子功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王丰青	河南农业大学农学院	34	188	8.0	12.0
2	李海朝	河南省农业科学院经济作物研究所	8	30	2.0	5.0
3	李金英	河南省农业科学院经济作物研究所	6	52	3.0	6.0
4	练云	河南省农业科学院经济作物研究所	8	36	3.0	6.0
5	魏荷	河南省农业科学院经济作物研究所	4	3	1.0	1.0
6	雷晨芳	河南省农业科学院经济作物研究所	5	3	1.0	1.0
7	武永康	河南省农业科学院经济作物研究所	6	10	2.0	3.0