鸡白痢沙门菌 spiC 基因克隆与生物信息学分析

• 作者: 安树敏 潘志明 焦新安 耿士忠 薛颖 郭荣显
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡白痢沙门菌 SpiC蛋白 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 6-10
• 页数: 5页
• 分类号: S852.612|Q785
• 字数: 3605字
• 语种: 中文

摘要

为了研究鸡白痢沙门菌 SpiC 蛋白的功能,以鸡白痢沙门菌 S06004基因组 DNA 为模板 PCR扩增 spiC 基因,进行克隆测序和生物信息学分析,并调查该基因在255株不同年代鸡白痢沙门菌分离株中的分布与进化情况。结果显示,鸡白痢沙门菌 spiC 基因全长384 bp,编码127个氨基酸,在不同年代分离株中稳定存在。推导 SpiC 蛋白无跨膜区、信号肽和卷曲螺旋结构,有1处酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,2处 N-豆蔻酰化位点,预测线性抗原表位主要分布在15-20、29-35、52-53、70-72、83-85、89-94 aa。利用 SWISS MOD-EL 在线程序建模,得到 SpiC 三维结构模型。同源性及进化分析显示 spiC 基因仅存在于沙门菌中且比较保守,鸡白痢沙门菌 SpiC 蛋白与沙门菌肠道亚种亲缘关系最近。