幽门螺杆菌 hp0521基因编码蛋白的生物信息学分析

• 作者: 倪颖 凃晶晶 徐青青 李欣悦 沈以新 沈楚莹 邵世和
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 cag 致病岛 hp0521 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 296-301
• 页数: 6页
• 分类号: R378.99|R393
• 字数: 3294字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13312/j.issn.1671-7783.y160081

摘要

目的：对4株幽门螺杆菌（Helicobacter pylori， Hp）中 hp0521基因编码的细胞毒素相关基因2（cytotoxin－asso－ciated gene 2，Cag2）蛋白从生物信息学角度进行基本理化性质、信号肽及功能的预测分析。方法：用 PCR 技术克隆测序获得4株 Hp 菌株的 hp0521基因序列，生物信息学工具分析其编码 Cag2蛋白的基本理化性质、有无信号肽及蛋白指纹图谱。结果：成功克隆测序4株 Hp 菌株的 hp0521基因序列，提交基因库后获得相应登录号；hp0521基因编码的Cag2蛋白氨基酸数目和相对分子质量大小不同，理论等电点偏碱性，为稳定亲水性蛋白，不存在信号肽；Cag2蛋白指纹图谱分析存在 DNA 拓扑异构酶Ⅰ、IL－3细胞因子、抗增殖蛋白 BTG1家族、介导细胞壁延伸的蛋白、卤酸脱卤酶／环氧水解酶、调节染色体凝集功能 RCC1家族等蛋白标签。结论： Hp 中 hp0521基因编码的 Cag2蛋白可能介导细胞壁延伸和调节染色体凝集，参与致病信号通路的传导，可能具有 DNA 拓扑异构酶Ⅰ、卤酸脱卤酶／环氧水解酶等相应酶活性。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邵世和	江苏大学医学院	99	382	9.0	14.0
2	倪颖	江苏大学医学院	6	29	2.0	5.0
3	徐青青	江苏大学医学院	2	1	1.0	1.0
4	凃晶晶	江苏大学医学院	2	1	1.0	1.0
5	沈楚莹	江苏大学医学院	2	1	1.0	1.0
6	沈以新	江苏大学医学院	2	2	1.0	1.0
7	李欣悦	江苏大学医学院	2	1	1.0	1.0