大豆病程相关蛋白PR-5及其同源蛋白TPLs的生物信息学分析

• 作者: 于志远 刘丽君 喻德跃 张丽 王伟威 魏崃
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆病程相关蛋白 类甜蛋白 系统进化分析 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 380-387
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2016.03.0380

摘要

大豆病程相关蛋白PR-5又称为类甜蛋白TLPs,广泛分布于高等植物体内,各种生物和非生物胁迫诱导(病原微生物、渗透胁迫,机械损伤和植物激素等)均可诱导其表达.本研究以PR-5编码基因Glyma01g42670.1为目的基因,对该基因及其同源蛋白的结构和功能进行了分析;通过生物信息学的方法,共筛选获得42条大豆TLPs蛋白质序列,并用Mega 4.1软件构建其系统进化树;同时对SoyBase中的大豆TLPs相关的表达数据进行分析.结果表明:大豆病程相关蛋白PR-5的编码基因Glyma01 g42670.1编码240个氨基酸的多肽链,pI 6.26,是一种酸性蛋白,属于疏水蛋白,该蛋白质具有典型的TLP家族的保守结构域,具有指导PR-5蛋白的跨膜转移(定位)的N端信号肽序列,PR-5蛋白不含有跨膜螺旋结构,主要存在于质外体中,属于分泌蛋白,推测该蛋白具有内切葡聚糖酶的催化活性,进化分析表明:该编码基因与拟南芥的NP_192902.1基因属于直系同源基因,它们是具有相同功能和共同起源的基因,组织表达特异性分析表明该基因主要在根部和花中表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丽	黑龙江省农业科院大豆研究所	248	273	6.0	9.0
2	刘丽君	黑龙江省农业科院大豆研究所	120	839	16.0	23.0
3	喻德跃	南京农业大学农学院	37	481	13.0	20.0
4	魏崃	黑龙江省农业科院大豆研究所	23	62	5.0	6.0
6	王伟威	黑龙江省农业科院大豆研究所	14	33	3.0	5.0
7	于志远	黑龙江省农业科院大豆研究所	11	7	2.0	2.0