大豆Glyma08g02580及其同源蛋白的生物信息学分析

• 作者: 刘冬冬 柏锡 王洋
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: WRKY 转录因子 生物信息学 系统进化分析 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 648-653
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2014.05.0648

摘要

WRKY蛋白是一个植物特有的转录因子,最古老的WRKY转录因子具有2个高度保守的WRKY结构域,大概起源于15亿～ 20亿年前的真核生物.虽然所有的WRKY蛋白质主要通过特异地结合靶基因启动子区域的W盒序列而调控其表达,但各家族成员的生物学功能存在着各自的特异性.通过生物信息学方法,结合大豆基因组数据库、高等植物基因组注释数据库和NCBI等相关数据库,识别、筛选并获得了大豆WRKY基因家族的蛋白序列,以实验室前期克隆得到大豆基因Glyma08g02580.1为目的基因,分析其在拟南芥、水稻等高等植物中的同源蛋白,并对其进行了系统进化分析;同时利用GEO的芯片数据对大豆在碱胁迫下的根和叶基因表达谱进行了分析,通过相关分析,获得了大豆基因组中全部的WRKY蛋白及对应的分类结果,由表达谱分析结果进一步证明了WRKY基因表达的组织特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柏锡	东北农业大学生命科学学院	80	891	15.0	26.0
2	王洋	东北农业大学生命科学学院	50	232	9.0	13.0
3	刘冬冬	东北农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0