大豆基因组GmRAV同源基因的生物信息学分析

• 作者: 李文滨 李海燕 滕卫丽 罗秋兰 赵琳 陈李淼 高阳
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 RAV 光周期 AP2/ERF结构域 B3结构域
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 550-554
• 分类号: Q945.48|S565.1
• 字数: 3445字
• 语种: 中文

摘要

利用Phytozome数据库、NCBI网站,和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中RAV同源基因进行了生物信息学分析,发现大豆RAV基因有4个拷贝,分别分布于第1、2、10和20号染色体上；RAV蛋白含有AP2/ERF (53～ 108)和B3( 172～ 286)结构域.豆科植物大豆、东方山羊豆和苜蓿RAV蛋白亲缘关系较近.大豆的RAV基因4个拷贝中,Glyma01 g22260与Glyma02g11060亲缘关系最近并且与苜蓿聚为一类,GmRAV和Glyma20g32730的亲缘关系也很近,并且与东方山羊豆聚为一类.推测大豆4个RAV拷贝在进化过程中功能上发生了较大的分化,在光周期抑制开花过程中可能发挥着重要作用.