大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析

• 作者: 傅永福 吴卓晶 庞保平
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 TOC1 生物钟 开花 系统发育
• 年，卷（期）: 2010,（8）
• 页码范围: 22-27,32
• 分类号: S565.1
• 字数: 5063字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-3268.2010.08.006

摘要

利用Phytome、 TAIR、 NCBI网站及其数据库和MEGA 4.0、Clustal X软件,对大豆(Glycine max)基因组中TOC1同源基因进行了生物信息学分析,确定了GmTOC1基因及其在染色体上的物理分布、内含子-外显子结构,进行了氨基酸序列比对,并研究了其系统发育学地位.结果表明,GmTOC1与AtTOC1亲缘关系较近,都具有保守的调节区域,而且可能具有相似的生物钟调控功能.此外发现,大豆基因组中含有4个拷贝的TOC1同源基因,它们在生物进化过程中保留了与拟南芥同源的结构和功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴卓晶	内蒙古农业大学农学院	1	0	0.0	0.0
5	庞保平	内蒙古农业大学农学院	104	1186	20.0	27.0
6	傅永福	中国农业科学院作物科学研究所	16	214	6.0	14.0