禽流感病毒广东株HA基因BLSOM神经网络分型方法的建立

• 作者: 刘志玲 吴晓薇 林志雄 田纯见 罗琼 陈茹 高佳卉 鱼海琼
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 禽流感病毒 BLSOM HA基因 神经网络 分型
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 农业工程·信息技术
• 页码范围: 156-160
• 页数: 5页
• 分类号: S852.65+9.3|S858.3
• 字数: 1955字
• 语种: 中文

摘要

利用25个禽流感病毒及相关流感病毒广东株HA基因序列,建立三、四核苷酸特征基因片段BLSOM神经网络分型方法,对各片段数量进行统计和归一化处理.设计程序由MATLAB函数模拟人脑思维自组织学习,当训练步数为100及以上各毒株能成功聚类.H1、H3、H5、H7和H9亚型主要毒株分别归为一类,其中H3N2和H7N9毒株HA基因聚类图谱高度相似,表明这些毒株起源相同;不同年代H5N1毒株差异较大;H1N1和H9N2各1个毒株聚为一类,表明这两种病毒自然重组变异,为高危毒株筛查和溯源提供参考.