小鼠烧伤后免疫细胞多功能紊乱的基因表达谱生物信息学分析

• 作者: 卢志阳 史鹏伟 杨磊 金辉 高艳彬
• 来源期刊: 广东医学
• 关键词: 细胞多功能紊乱 基因芯片 生物信息学分析 功能富集分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 211-214
• 页数: 4页
• 字数: 2927字
• 语种: 中文

摘要

目的：探讨小鼠烧伤后外周血免疫细胞基因表达差异，并对差异基因行生物信息分析，从分子水平全面探讨烧伤后免疫细胞功能变化情况，为临床治疗提供新靶点。方法在GEO数据库中下载基因芯片数据（GSE7404，小鼠，25％TBSA，3度），经过芯片质量评估后，获取差异基因，分别应用go－function数据集及DAVID Bioinformatics Resources 6．7对差异基因进行基因本体、生物学通路分析，获得差异基因相关功能的功能富集类。结果在烧伤后第1天筛选到1825个差异基因，其中上调基因658个，下调基因1167个。 Gene Ontology分析显示小鼠烧伤后免疫细胞与免疫系统过程、细胞过程、代谢过程、应对刺激反应、生物调节及死亡等功能高度相关。KEGG通路分析显示上调基因主要富集到免疫系统、细胞生长与死亡及代谢相关通路；而下调基因则主要与免疫及代谢通路相关。结论烧伤是一个复杂的病理生理过程，会引起多种基因表达调控的改变。基因芯片表达谱的生物信息学分析可以在转录水平反映免疫细胞在烧伤后的分子生物学过程，有助于全面认识烧伤后免疫细胞功能紊乱的发生机制。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨磊	南方医科大学南方医院烧伤科	55	328	10.0	14.0
2	高艳彬	南方医科大学南方医院烧伤科	8	46	5.0	6.0
3	金辉	南方医科大学南方医院烧伤科	5	21	3.0	4.0
4	卢志阳	南方医科大学南方医院烧伤科	7	41	4.0	6.0
5	史鹏伟	南方医科大学南方医院烧伤科	8	44	4.0	6.0