基于高通量测序的冷冻南极磷虾中细菌菌群结构分析

• 作者: 姚琳 朱文嘉 李风铃 江艳华 王联珠 郭莹莹
• 来源期刊: 食品安全质量检测学报
• 关键词: 南极磷虾 细菌菌群 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 食品分析与检测
• 页码范围: 2840-2845
• 页数: 6页
• 字数: 4381字
• 语种: 中文

摘要

目的 分析冷冻南极磷虾中总细菌菌群和可培养细菌菌群的结构特征.方法 提取冷冻南极磷虾中宏基因组,通过高通量测序技术进行总细菌菌群分析;提取冷冻南极磷虾中可培养细菌菌落的总DNA,通过高通量测序技术进行可培养细菌菌群分析.结果 冷冻南极磷虾中总细菌菌群多样性丰富,相对丰度大于1％的包括芽孢杆菌属(Bacillus)、肠球菌属(Enterococcus)、克罗诺杆菌属(Cronobacter)、嗜碱菌属(Alkaliphilus)、八叠球菌(Sarcina)、乳球菌属(Lactococcus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、土壤杆菌属(Sediminibacterium)、未分类菌(unclassified)、罗尔斯顿菌属(Ralstonia)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)以及苯基杆菌属(henylobacterium),占总量的85.04％.冷冻南极磷虾中可培养的细菌种类少,主要包括假交替单孢菌属(Pseudoalteromonas)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和嗜冷单胞菌属(Psychromonas),相对丰度分别为64.43％、33.47％和1.75％.可培养细菌中占优势的假交替单孢菌属、嗜冷杆菌属和嗜冷单胞菌属仅占总细菌菌群的1.10％.结论 本研究初步揭示了南极磷虾细菌菌群的多样性和相对丰度,为进一步研究微生物与南极磷虾品质的相关性奠定基础.