基于蛋白质互作网络的鼻咽癌基因模块化分析

• 作者: 孙娟 崔晓波 张姝
• 来源期刊: 局解手术学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 蛋白质互作网络 基因模块化分析
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 781-783,784
• 页数: 4页
• 分类号: R739.65
• 字数: 2854字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11659/jjssx.03E016095

摘要

目的：基于蛋白质互作网络，筛选调节鼻咽癌的基因模块，为鼻咽癌的分子诊断和治疗提供新的靶点。方法利用 GEO 数据库中鼻咽癌的数据集（GSE12452）和 SAM软件，筛选鼻咽癌中差异表达基因。利用 String 数据库，建立鼻咽癌中差异表达基因的蛋白质互作网络。基于构建的网络，利用生物信息学模块化分析方法筛选在鼻咽癌发生发展过程中起重要作用的基因模块。根据 DAVID 数据库，对模块进行 GO 分析，挖掘模块的调控功能。结果本次研究中共筛选出在鼻咽癌中差异表达的基因2634个。根据 String 数据库，我们发现这些差异基因中共有4729对蛋白质互作对，并据此建立鼻咽癌中的蛋白质互作网络。利用模块化分析筛选出蛋白质互作网络中的7个基因模块，GO 分析显示这些模块的功能主要为调控细胞周期、糖代谢、细胞黏附、氧化还原反应等。结论鼻咽癌的蛋白质互作网络中共有7个基因模块，它们对鼻咽癌的发生发展具有重要的调控作用，这些功能模块的发现能够为鼻咽癌的分子靶向诊治提供新的切入点。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔晓波	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	50	85	5.0	7.0
2	张姝	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	9	58	2.0	7.0
3	孙娟	内蒙古医科大学附属医院耳鼻咽喉科	20	29	4.0	4.0