基于基因表达谱数据筛选差异表达基因新方法

• 作者: 丁勇 刘康 刘成友 吴静 周鑫 秦航 蒋红兵
• 来源期刊: 数学的实践与认识
• 关键词: 基因表达谱 差异表达基因 错误发现率 假阴性率 假阳性率 灵敏度变异度
• 年，卷（期）: 2016,（18）
• 所属期刊栏目: 工程
• 页码范围: 122-128
• 语种: 中文

摘要

提出一种基于基因表达谱数据筛选差异表达基因的新方法;介绍了筛选差异表达基因常见方法-错误发现率方法(False Discovery Rate,FDR),分析了多重假设检验p值性质,并根据p值性质提出了一种筛选差异表达基因新方法-单位γ度量法(Unit Measure-γ,UM-γ),建立了计算机模拟基因表达谱数据模型,制定了假阴性率、假阳性率、灵敏度、特异度以及总体错误率等作为考核指标,并使用基因表达谱模拟数据进行计算、比较;单位γ度量法估计非差异表达基因个数具有较高的稳定性和准确性;单位γ度量法既能够同时控制假阳性、假阴性以及总体错事件的发生,又能在一定程度上提高筛选结果的灵敏度和变异度;新提出的方法能有效、准确且稳定的对模拟数据差异表达基因进行筛选.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蒋红兵	南京医科大学附属南京医院医疗设备处	102	657	14.0	18.0
2	吴静	南京医科大学数学与计算机系	53	290	10.0	15.0
3	丁勇	南京医科大学数学与计算机系	46	118	5.0	9.0
7	周鑫	南京医科大学附属南京医院医疗设备处	12	44	4.0	6.0
8	刘成友	南京医科大学附属南京医院医疗设备处	23	72	4.0	6.0
9	刘康	青岛理工大学土木工程系	7	23	3.0	4.0