甘蓝型油菜SHR蛋白基因鉴定与结构分析

• 作者: 刘慧萍 陈永勤 顿小玲 黄毅
• 来源期刊: 湖北大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 SHR基因 基因结构 氨基酸序列 三级结构
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 生命科学与医药卫生
• 页码范围: 620-627
• 页数: 8页
• 分类号: S565.4
• 字数: 5072字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2375.2017.06.011

摘要

植物SHR蛋白属于GRAS蛋白转录因子家族,保守羧基端含有VHIID结构域,氨基端不保守,参与调控植物物质合成和生长发育.参照拟南芥AtSHR基因的CDS序列,采用生物信息学的方法在甘蓝型油菜数据库中鉴定出3个BnSHR基因,进而分析其基因结构、生化特性、进化关系和蛋白结构.研究结果显示3个BnSHR基因中有2个位于C基因组(来源于甘蓝)上,1个位于A基因组(来源于白菜);3个BnSHR基因的氨基酸序列一致性为88.25％,与AtSHR基因在进化上也高度同源,SHR基因在结构和功能上保守;亚细胞定位预测显示BnSHR蛋白可能定位于过氧化物酶体,参与种子萌发过程中脂肪转变为糖分的过程;PHYRE2预测了BnSHR蛋白的三级结构,由于序列的差异性导致了氨基末端处结构相差较大,但VHIID保守区结构类似,为β-折叠.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈永勤	湖北大学生命科学学院	24	223	8.0	14.0
2	黄毅	中国农业科学院油料作物研究所农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室	5	58	3.0	5.0
3	刘慧萍	湖北大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
7	顿小玲	中国农业科学院油料作物研究所农业部油料作物生物学与遗传育种重点实验室	2	0	0.0	0.0