泥蚶胰岛素生长因子1受体基因的cDNA全长克隆及表达分析

• 作者: 任付真 姚韩韩 林志华 董迎辉 钱雪骏
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 泥蚶 Tg-IGF1R基因 克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 40-51
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20151210197

摘要

为了研究IGF1R基因在泥蚶生长、发育过程中的调控作用,本研究基于泥蚶转录组文库的EST,利用SMART RACE技术首次克隆获得泥蚶IGF1R基因(Tg-IGF1R) cDNA全长序列,该序列全长为5793 bp,开放阅读框为4638bp,编码1546个氨基酸.经生物信息学分析发现,该基因5'端非编码区为810 bp,3’端非编码区为345 bp,Tg-IGF1R蛋白分子量为176.01ku,等电点为6.04,包含4个Ⅲ型纤粘连蛋白结构域,1个半胱氨酸富集区和1个酪氨酸激酶结构域,属于亲水性跨膜蛋白质.氨基酸多重比对显示Tg-IGF 1R蛋白序列与人、非洲爪蟾、斑马鱼的相似性分别为45.2％、45.6％和45.4％.利用qRT-PCR技术检测了Tg-IGF1R基因在泥蚶成体不同组织及幼体不同发育时期的表达情况,发现该基因具有广泛的组织表达性,在所检测的6个组织(血液、闭壳肌、斧足、鳃、内脏团和外套膜)中均有不同程度的表达,其中血液中的相对表达量最高,并与其余5个组织间存在显著性差异,推测Tg-IGF1R以信号分子的形式参与多种组织细胞的生命过程.Tg-IGF1R基因在泥蚶个体发育过程中的9个时期均有表达,且高表达主要集中在原肠胚期,其次是担轮幼虫期和稚贝期,说明Tg-IGF1R基因可能在早期发育阶段参与了某些器官的形成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林志华	浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	66	512	13.0	17.0
2	姚韩韩	浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	22	170	9.0	12.0
3	任付真	浙江万里学院生物与环境学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	2	2	1.0	1.0
7	钱雪骏	上海海洋大学水产与生命学院	2	11	2.0	2.0