基于GO分析的全基因组芯片筛选小鼠牙囊发育早期差异表达基因的研究

• 作者: 党平 孟庆岩 安钰 张春光 王洪云 聂敏媛 董蕊
• 来源期刊: 牙体牙髓牙周病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 激光显微切割技术 牙胚发育 基因芯片 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 123-128,163
• 页数: 7页
• 分类号: R780.2
• 字数: 4724字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15956/j.cnki.chin.j.conserv.dent.2017.03.001

摘要

目的:利用基于GO 分析的全基因组芯片技术筛选小鼠牙囊组织在个体发育不同时期的差异表达基因.方法:以激光显微切割技术获取胚胎17 d(E17)和出生后2 d(PN2)两个时期小鼠下颌第一磨牙的牙囊组织后,以改良Trizol法提取总RNA并制备荧光标记的cRNA;然后再以Aglient 小鼠全基因组表达芯片对比分析上述两时期的基因表达差异;最后以GeneSpringGX 7.3软件对所得结果进行归一化及倍数筛选,并分别以BioCarta、GenMAPP软件进行基因分类和GO分析.结果:①得到两个发育时期牙囊组织相对于牙乳头组织表达倍数都在10倍以上的一组基因;②得到细胞外基质等10余项常见生物功能相关的基因列表.结论:将激光显微切割以及基因表达芯片两种技术联合可用于小鼠牙周组织发育过程中差异表达基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	聂敏媛		12	16	2.0	3.0
2	党平		22	182	6.0	13.0
3	孟庆岩		4	13	2.0	3.0
4	董蕊	首都医科大学口腔医学院	7	7	2.0	2.0
5	张春光		13	21	3.0	4.0
6	王洪云	天津海滨人民医院口腔科	4	11	2.0	3.0
7	安钰		1	2	1.0	1.0