基于基因功能相似性预测小分子药物与lncRNA的相关关系

• 作者: 付强 吕莹丽 宁尚伟 杨磊 王世缘 闫琰
• 来源期刊: 哈尔滨医科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 小分子 lncRNA 关联关系 功能相似性
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 404-408
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3547字
• 语种: 中文

摘要

目的 开发靶向表达失调的非编码RNA的小分子药物,以提供一种全新的癌症治疗策略.方法 通过整合小分子与lncRNA的靶基因数据,基于基因功能相似性,构建小分子与lncRNA关联关系模型,预测小分子潜在相关的lncRNAs,对显著相关的小分子-lncRNA关联网络进行拓扑性和功能性分析,依据数据库和文本挖掘评价预测的小分子-lncRNA关系.结果 得到280个小分子与79个lncRNA之间805对显著相关关系;网络中小分子节点呈现幂律分布;同一小分子靶向的lncRNA对共享疾病(5.0995×10-6),同一lncRNA关联的小分子对共享疾病(3.1577×10-28)和副作用(2.1668×10-67),并具有相似的化学结构(2.053×10-62);在慢性骨髓白血病、恶性胃肠道间质瘤中,MEG3、H19、HOTAIR与伊马替尼存在潜在关联;FENDRR与Glisoxepide在糖尿病肾病治疗中存在潜在关联.结论 基于基因功能相关性为预测小分子相关lncRNAs提供了一条新途径,促进了癌症靶向治疗的发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨磊	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	12	32	3.0	5.0
2	宁尚伟	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	5	1	1.0	1.0
3	吕莹丽	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	6	28	2.0	5.0
4	付强	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	5	7	1.0	2.0
5	王世缘	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	5	6	2.0	2.0
6	闫琰	哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院	1	0	0.0	0.0