整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析

• 作者: 周忠文 孙淑红 孙鹏 崔宁 崔治中 苏帅
• 来源期刊: 中国兽药杂志
• 学科: 农学
• 关键词: REVLTR 重组MDV 感染性克隆 高通量测序 全基因组
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 微生物与免疫
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: S852.6
• 字数: 4339字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11751/ISSN.1002-1280.2017.10.01

摘要

GX0101是一株整合禽网状内皮组织增生症病毒(REV)长末端重复序列(LTR)的重组马立克氏病病毒(MDV).基于MDV GX0101的细菌人工染色体感染性克隆利用高通量测序技术完成了对其全基因组的序列分析.GX0101全基因组长178101 bp,其基因组的TRL、UL、IRL、IRS、US和TRS区分别长12758 bp、113572 bp、12741 bp、12700 bp、11695 bp、13134 bp.与Md5不同,GX0101含有一个sorf2基因.同时,GX0101全基因组含有一个REV LTR重组片段,位于其基因组US区的sorf1中,sorf2基因前267 bp碱基处.通过与已发表的近10株MDV的比较,发现GX0101与英国分离株C12/130的两个不同毒力的感染性克隆pC12/130-10和pC12/130-15同源性最高.GX0101的全基因组序列的比较分析,有助于进一步阐明MDV致病性、传播性相关的基因,也有助于揭示不同地域间MDV的遗传变异和演化关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔治中	山东农业大学动物科技学院	339	5341	37.0	59.0
2	孙淑红	山东农业大学动物科技学院	81	1188	21.0	31.0
3	苏帅	山东农业大学动物科技学院	18	75	6.0	8.0
4	孙鹏	山东农业大学动物科技学院	10	24	3.0	4.0
5	周忠文	山东农业大学动物科技学院	2	1	1.0	1.0
6	崔宁		4	6	1.0	2.0