菊芋抗逆性评估及HtCPI基因的克隆与表达分析

• 作者: 刘丹 刘鹏 吴玉环 徐根娣 曹林 章艺 郦枫 马丽
• 来源期刊: 浙江师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 菊芋 胁迫 半胱氨酸蛋白酶抑制剂 克隆 表达 基因
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 188-195
• 页数: 8页
• 分类号: S567.23
• 字数: 5628字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16218/j.issn.1001-5051.2017.02.011

摘要

在逆境胁迫测试的基础上,利用RT-PCR技术从菊芋叶片中克隆了半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因的完全开放阅读框序列,并进行了生物信息学和胁迫表达分析.结果表明:获得的基因序列具有半胱氨酸蛋白酶抑制剂特征性的结构域,HtCPI由333 bp的核苷酸组成;蛋白质结构预测,HtCPI推定的HtCY蛋白具有跨膜结构和信号肽;系统进化树分析,HtCY与山杨的CY蛋白相似性为96％,与姜黄的CY相似性为94％;经氨基酸序列比对,推断该蛋白有一个高度保守的QKVKQ结构域和一个保守的LAKFAVDHHN结构域;蛋白质亚细胞定位结果表明,HtCY可能位于内质网上.组织特异性检测表明,HtCPI在菊芋根、茎、叶中均有表达,在茎中的表达量最高.实时定量荧光PCR分析表明,水杨酸、氯化钠、氯化铝和聚乙二醇等处理均能诱导菊芋根和叶中HtCPI基因表达上调;荧光定量分析显示,虽然在不同的胁迫因子条件下其上调的程度有一定的差异,但均在4h后表达量发生明显的上升,即对水杨酸、氯化钠、氯化铝和聚乙二醇等处理均存在转录响应.推测该基因参与了菊芋对生物或非生物胁迫的防御机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘鹏	浙江师范大学化学与生命科学学院	320	6773	41.0	60.0
2	徐根娣	浙江师范大学化学与生命科学学院	197	3575	31.0	44.0
3	吴玉环	杭州师范大学生命与环境科学学院	46	221	8.0	12.0
4	章艺		9	99	7.0	9.0
5	曹林	浙江师范大学化学与生命科学学院	5	27	4.0	5.0
6	马丽	浙江师范大学化学与生命科学学院	5	11	2.0	3.0
7	郦枫	浙江师范大学化学与生命科学学院	3	6	1.0	2.0