基于高通量测序的福安刺葡萄基因组初步研究

• 作者: 刘鑫铭 周平 蔡盛华 陈婷 雷龑
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 高通量测序 福安刺葡萄 基因组
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 134-137
• 页数: 4页
• 分类号: S661.2
• 字数: 4863字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.02.006

摘要

为进一步了解福建福安刺葡萄的遗传背景,寻找刺葡萄与欧亚种葡萄之间的遗传差异,本研究基于高通量测序技术展开对福安刺葡萄基因组的分析,共得到测序数据8.4 Gb,鉴定出3 192 484处非冗余遗传差异.差异位点分布位置结果显示,30.34%的差异位于基因间区,3.67%的差异位于基因外显子区.通过对比葡萄参考基因组序列,共鉴定出刺葡萄基因组上存在1 863 237个同源SNP、1 244 590个异源SNP位点,表明本次测序所用的福安刺葡萄有可能是异源二倍体.