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盐角草PsaH基因的克隆及生物信息学分析
盐角草PsaH基因的克隆及生物信息学分析
作者:
李建平
足木热木·吐尔逊
郝晓燕
高升旗
黄全生
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
盐角草
SePsaH基因
生物信息
摘要:
[目的]从盐生植物盐角草(Salicornia europaea)中克隆得到一个参与光合反应光系统Ⅰ(PSI)复合蛋白H亚基的PsaH基因,分析该基因进行生物信息学,为研究该基因的作用奠定基础并为改良作物耐盐性分子育种提供候选基因.[方法]以盐生植物盐角草为实验材料,采用RT-PCR方法克隆PsaH基因,利用NC-BI、MEGA、Expasy等生物信息学工具对其核酸序列、编码的氨基酸序列及蛋白质的结构和功能进行分析.[结果]克隆得到一个与耐盐有关的基因,命名为SePsaH,属于光系统Ⅰ(PSI)家族H亚基成员,其开放阅读框(ORF)为438 bp,基因编码145个氨基酸,预测蛋白分子量为15.3 kD,等电点9.84,是亲水性蛋白;系统进化树分析表明其与菠菜亲缘关系较近,通过对该蛋白保守性分析发现其含有4个保守性结构域.[结论]获得盐角草SePsaH基因,为进一步研究该基因耐盐功能及其在盐生植物耐盐机制中的作用提供了基础.
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文献信息
篇名
盐角草PsaH基因的克隆及生物信息学分析
来源期刊
新疆农业科学
学科
农学
关键词
盐角草
SePsaH基因
生物信息
年,卷(期)
2017,(9)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1613-1620
页数
8页
分类号
S188
字数
5052字
语种
中文
DOI
10.6048/j.issn.1001-4330.2017.09.006
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李建平
新疆农业科学院核技术生物技术研究所
14
83
6.0
8.0
2
郝晓燕
新疆农业科学院核技术生物技术研究所
11
32
3.0
5.0
3
黄全生
新疆农业科学院核技术生物技术研究所
17
66
5.0
7.0
4
足木热木·吐尔逊
新疆农业科学院核技术生物技术研究所
3
3
1.0
1.0
5
高升旗
新疆农业科学院核技术生物技术研究所
4
12
1.0
3.0
传播情况
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引文网络
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(13)
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节点文献
盐角草
SePsaH基因
生物信息
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
新疆农业科学
主办单位:
新疆农业科学院
新疆农业大学
新疆农学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-4330
CN:
65-1097/S
开本:
大16开
出版地:
新疆乌鲁木齐市南昌路403号
邮发代号:
58-18
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
6386
总下载数(次)
3
总被引数(次)
41809
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