盐地碱蓬PsaH基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 常晓春 李建平 足木热木 郝晓燕 陈果 高升旗 黄全生
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 盐地碱蓬 SsPsaH基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 页码范围: 1209-1217
• 页数: 9页
• 分类号: S188
• 字数: 5382字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2018.07.005

摘要

[目的]PsaH基因是编码光合反应光系统I(PSI)复合蛋白H亚基的基因.为深入开展该基因的耐盐功能研究及其在盐生植物耐盐机制中的作用提供了基础,并为改良作物耐盐性分子育种提供候选基因.[方法]研究从盐地碱蓬(Suaeda salsa)盐胁迫文库中筛选出一个与耐盐相关的PsaH基因,经测序获得全长cDNA序列,命名为SsPsaH(GeneBank Accession Number:KC4048847),对该基因进行生物信息学分析进行结构功能预测.[结果]该基因全长770 bp,开放阅读框(ORF)为438 bp,编码145个氨基酸;该基因所编码的蛋白定位于叶绿体膜系统,无信号肽,含有一个跨膜结构的亲水性不稳定蛋白,二级结构多为无规则卷曲.同时,该基因在不同物种间具有较强的保守性,含有4个高度保守的结构域,系统进化树分析表明,其与菠菜亲缘关系最近.RT-PCR分析表明,SsPsaH基因在根、茎、叶中均有表达,但在茎和叶中表达量高于根.[结论]SsPsaH基因是编码光合反应光系统I(PSI)复合蛋白H亚基的基因.本研究为以后深入开展该基因的耐盐功能研究及其在盐生植物耐盐机制中的作用提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李建平	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	14	83	6.0	8.0
2	郝晓燕	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	11	32	3.0	5.0
3	常晓春	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	12	78	5.0	8.0
4	陈果	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	8	16	2.0	3.0
5	高升旗	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	4	12	1.0	3.0
6	足木热木	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	6	2	1.0	1.0