基于PasteurMLST网站分析中国单增李斯特菌克隆复合体的多样性

• 作者: 张昭寰 潘迎捷 王旭 赵勇
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 医学
• 关键词: 单增李斯特菌 克隆复合体 多位点序列分型 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 遗产育种·分子遗传学
• 页码范围: 16-23
• 页数: 8页
• 分类号: R155.5|R378
• 字数: 4108字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2017.04.04

摘要

为了了解中国分离的单增李斯特菌克隆复合体的多样性,利用了PasteurMLST网站上公布的数据,获得了1987-2015年具有序列型(Sequence type,ST)的来自中国的单增李斯特菌53条菌株数据,进行了克隆复合体的多样性分析.结果表明:53条菌株数据中可分为44个ST型,以ST 705型居多(共6株,占总数的11.3％);所有提交菌株的来源广泛,以1/2a血清型为主,南方地区的菌株数与ST型数均多于北方地区.利用eBURST软件对数据进行总体分析,共发现了单个ST型18个,2个ST型的克隆复合体5个,4个ST型的克隆复合体1个,5个ST型的克隆复合体1个,7个ST型的克隆复合体1个,其中CC155是最大的克隆复合体(占总菌株的24.5％).进一步分析得知克隆复合体与菌株来源关系密切.系统发育树分析得出CC9与CC155存在较近的进化关系,并且氨基酸序列构建的系统发育树比核苷酸更加准确.由此可见,基于PasteurMLST网站分析的中国单增李斯特菌具有较高的遗传多样性,MLST分型以ST 705为多,克隆复合体以CC155为主,这为进一步研究单增李斯特菌的溯源以及进化关系奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王旭	上海海洋大学食品学院	6	35	3.0	5.0
3	张昭寰	上海海洋大学食品学院	10	54	4.0	7.0