丝瓜LcWRKY21转录因子基因的克隆与表达分析

• 作者: 刘建汀 张前荣 朱海生 林珲 温庆放 王彬 薛珠政 陈敏氡
• 来源期刊: 中国细胞生物学学报
• 关键词: 丝瓜 LcWRKY21 转录因子 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1268-1278
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11844/cjcb.2017.010.0178

摘要

采用RT-PCR和Race技术从普通丝瓜果肉中分离到1条长达1 809 bp的cDNA,并对其进行序列分析.结果表明,该序列包含1个1 044 bp的开放读码框(open reading frame,ORF);预测编码347个氨基酸,理论分子量为38.61 kDa,等电点为9.46;编码蛋白质与甜瓜(Cucumis melo)和黄瓜(Cucumis sativus)同源蛋白的相似性达到84％以上,具有高度的保守性,基因命名为Lc WRKY21.Wolf Psort预测其亚细胞定位于细胞核(nucleus)内.Motif Scan分析显示,LcWRKY21蛋白质的氨基酸序列274～340位、279～339位和325—337位分别为WRKY保守结构域、DNA结合结构域及锌指结构域序列.同源性分析表明,丝瓜LcWRKY21的锌指结构为C2H2型,属于第Ⅱ类WRKY蛋白质家族.荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)分析显示,Lc WRKY21具有组织表达特异性,在普通丝瓜品种“福丝2号”果实中表达量最高,其次为根和茎,在叶片和花中的表达量较低.Lc WRK Y21基因在6个丝瓜品种中的表达水平具有品种差异性,在易褐变普通丝瓜品种“福丝2号”中的表达量最高,其次为普通丝瓜“福丝3号”和“福丝4号”,在有棱丝瓜“福丝5号”、“福丝6号”和不易褐变的普通丝瓜品种“福丝1号”中的表达量较低.分析发现,LcWRKY21在“福丝2号”不同成熟时期中的表达量呈先上调后下调的趋势,在授粉后35 d的表达丰度达到最高.此外,Lc WRKY21在普通丝瓜品种“福丝2号”的表达水平呈先上调后下调的趋势,鲜切后3h时表达量达到最高,随后出现下调.初步推测,转录因子Lc WRKY21基因在丝瓜果肉褐变过程中起着一定的调控作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛珠政		79	312	10.0	14.0
2	温庆放		108	864	14.0	25.0
3	朱海生		53	277	10.0	14.0
4	林珲		33	137	8.0	11.0
5	张前荣		15	7	1.0	2.0
6	刘建汀		15	5	1.0	2.0
7	王彬		18	5	1.0	2.0
8	陈敏氡		23	23	2.0	4.0