基于序列和结构特征的蛋白质自由能预测

• 作者: 江家文 罗海琼 陈庆锋 鲁帮力
• 来源期刊: 广西科学
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质交互 自由能 特征选择 回归模型
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 计算科学
• 页码范围: 286-291
• 页数: 6页
• 分类号: TP399
• 字数: 3582字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13656/j.cnki.gxkx.20170601.002

摘要

[目的]蛋白质自由能不仅能准确地反应蛋白质的交互,而且对药物设计有巨大帮助.因此,选择建立精确的蛋白质自由能回归模型是非常有必要的.[方法]收集135对蛋白质复合物并计算600个特征,通过最小冗余最大相关(mRMR)选择与蛋白质自由能显著相关的特征并去除冗余特征,从而得到最小冗余最大相关的特征集,用筛选后的特征建立6种回归模型,并对选择后的特征进行移除对比分析特征的重要性;最后通过10折交叉验证对比得到最佳模型,预测蛋白质自由能.[结果]相对于其它方法,本研究所建立的模型在预测135对蛋白质复合物的性能,相对于其它方法有着较高的相关系数和较低平均绝对误差.[结论]本实验所用方法比其他方法选出的模型有更好的预测精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗海琼	广西医科大学信息与管理学院	11	21	3.0	4.0
2	鲁帮力	广西大学计算机与电子信息学院	1	0	0.0	0.0
3	陈庆锋	广西大学计算机与电子信息学院	8	2	1.0	1.0
7	江家文	广西大学计算机与电子信息学院	1	0	0.0	0.0