黄连属植物DNA条形码研究

• 作者: 何小慧 刘俊 吴丁 张志勇 朱昌兰 李波 李波超 袁庆军 闵道长
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA条形码 分子鉴定 中药 黄连属
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺与作物科学
• 页码范围: 1089-1095
• 页数: 7页
• 分类号: Q943
• 字数: 3388字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13836/j.jjau.2017141

摘要

本研究基于黄连属(Coptis Salisb.)的大尺度取样,全面评估了叶绿体DNA序列psbA-trnH和ycf1,及核DNA序列ITS和ETS在黄连属物种鉴定中的有效性.综合分析了不同候选序列的特征,计算种内种间遗传距离,评估序列的条形码间距,及构建邻接树,发现各片段种内变异率都远小于种间变异率,4个片段都不存在明显的条形码间距,单一片段鉴定效率仅在47%~63%,而片段组合中,双片段组合ITS+ycf1具有最高的分辨率(达到79%),与3片段组合ITS+ETS+ycf1及4片段组合(ITS+ETS+ycf1+psbA-trnH)鉴定率相同,且能成功鉴定中药黄连的原植物,即三角叶黄连(C.deltoidea)、云南黄连(C.teeta)和黄连(C.chinensis).因此,笔者建议将ITS+ycf1序列组合作为中药黄连鉴定的标准条形码.