ITS2序列作为DNA条形码鉴定紫堇属植物的有效性研究

• 作者: 夏娇丽 徐攀 李冉 王丹依 赵伟春 陈京
• 来源期刊: 浙江中医药大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 紫堇属 DNA条形码 ITS2 遗传距离 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 97-102,111
• 页数: 7页
• 分类号: R331
• 字数: 4022字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16466/j.issn1005-5509.2017.02.001

摘要

[目的]利用DNA条形码技术对6种紫堇属植物进行分子鉴定,评价内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对紫堇属植物的鉴别能力.[方法]从江苏南京、安徽合肥、浙江磐安、浙江缙云等地采集紫堇(Corydalis edulis)、黄堇(C.pallida)、小花黄堇(C.racemosa)、延胡索(C.yanhusuo)、东北延胡索(C.ambigua)和刻叶紫堇(C.incisa)6种紫堇属植物共29份样品.提取其DNA后用ITS2序列的通用引物进行PCR扩增并测序,运用CodonCode Aligner软件拼接和校对序列,MEGA5.1软件分析序列并构建K2P模型的邻接树.[结果]ITS2序列对所研究的29个样品的扩增和测序成功率均为100%.ITS2序列长度在225bp~248bp间,保守位点190个,变异位点71个,变异比例为27.2%.首次扩增获得小花黄堇和紫堇的ITS2序列并上传至GenBank.6个物种的种内遗传距离为0~0.0206,种间遗传距离为0.0403~0.1678,小花黄堇和黄堇的遗传距离最小;黄堇与刻叶紫堇的遗传距离最大.不同物种在邻接树中各自进化为单系.6种紫堇属植物的ITS2二级结构均有不同程度的差异.[结论]ITS2序列能够准确鉴定紫堇、黄堇、小花黄堇、延胡索、东北延胡索和刻叶紫堇这6种紫堇属植物,对中药鉴定具有潜在的应用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈京	浙江中医药大学生命科学学院	48	259	6.0	14.0
2	赵伟春	浙江中医药大学生命科学学院	68	227	9.0	12.0
3	徐攀		8	23	2.0	4.0
4	夏娇丽	浙江中医药大学生命科学学院	2	7	2.0	2.0
5	王丹依	浙江中医药大学生命科学学院	3	6	2.0	2.0
6	李冉	浙江中医药大学生命科学学院	2	2	1.0	1.0