葡萄CIPK基因家族的鉴定表达分析

• 作者: 毛娟 胡炜 路志浩 霍建强 马钰
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 CIPK家族 基因克隆 生物信息学分析 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 页码范围: 1619-1630
• 页数: 12页
• 分类号: S663.1
• 字数: 6966字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2017.11.008

摘要

以水稻、玉米、拟南芥中已知CIPK基因注册序列为基础,从葡萄基因组数据库中电子克隆出16条CIPK基因.对其理化性质分析表明,除VvCIPK10编码的251个氨基酸数目外,其余氨基酸数目基本稳定为300～470.整个CIPK家族的理论等电点为6～9.基因结构分析表明,VvCIPK01、VvCIPK03、VvCIPK04、VvCIPK08、VvCIPK09、VvCIPK13包含外显子数都大干10;VvCIPK02、VvCIPK05、VvCIPK06、VvCIPK07、VvCIPK10、VvCIPK11、VvCIPK12、VvCIPK14、VvCIPK15、VvCIPK16包食外显子数都小于7.聚类分析表明,CIPK基因被分为4个亚族,且在每一个亚族中都包含葡萄和拟南芥的CIPK基因家族成员,说明它们具有很高的同源性.对CIPK蛋白质的二级结构分析表明,葡萄CIPK基因家族所编码的蛋白质均以α螺旋和不规则卷曲为主,而β转角最少.亚细胞定位后发现,VvCIPK基因在细胞质中表达最多.对葡萄CIPK基因家族上游2 kb区域顺式作用元件分析表明,VvCIPK13对于ABA和脱水胁迫的响应最为明显,葡萄CIPK基因家族对于MYB转录因子和WRKY转录因子均有响应.荧光定量分析表明,VvCIPK15在根中表达量最多,在茎中表达量最少;在不同处理下该基因表达差异性显著.其中,受PEG、ABA、NaC1诱导后呈明显上调表达,其表达量依次为PEG＞NaCl＞ABA.同时该基因在受到高、低温胁迫时表达量也有明显上调,9个处理中只有在山梨糖中呈下调表达.推测该基因能够参与调控干旱、盐碱、低温等逆境过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毛娟	甘肃农业大学园艺学院	91	429	10.0	18.0
2	路志浩	甘肃农业大学园艺学院	1	3	1.0	1.0
3	霍建强	甘肃农业大学园艺学院	4	6	2.0	2.0
4	马钰	甘肃农业大学园艺学院	4	4	1.0	2.0
5	胡炜	甘肃农业大学园艺学院	1	3	1.0	1.0