新疆地区58株鼠疫耶尔森菌规律聚集的间隔短回文重复位点多态性分析

• 作者: 张志凯 张渝疆 李伟 梁莹 王宇萌 蔡虹 贺金荣
• 来源期刊: 中国媒介生物学及控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 鼠疫耶尔森菌 多态性 新疆维吾尔自治区
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 233-237
• 页数: 5页
• 分类号: R378.6+1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2017.03.009

摘要

目的 了解新疆维吾尔自治区(新疆)鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)规律聚集的间隔短回文重复(CRISPR)位点的遗传多态性,对菌株进行基因分型.方法 利用PCR技术对分离自新疆的58株鼠疫菌的基因组DNA进行扩增,测定扩增产物的核酸序列,分析各菌株CRISPR位点的间区序列种类和排列情况,应用Bionumerics软件制作聚类图,确定菌株基因型.结果 共鉴定42个间区序列和23种间区序列阵列,58株鼠疫菌分为16个基因型,即基因3型、8型、11型和16型,主要分布在新疆乌恰县、和田地区、尼勒克和玛纳斯县;基因7型的鼠疫菌全部分离自新疆准噶尔盆地大沙鼠及其体表寄生蚤;其他型别的鼠疫菌则主要分布在新疆北天山和准噶尔盆地.结论 新疆地区的鼠疫菌CRISPR位点遗传多态性较高,不同基因型的鼠疫菌地理分布有明显的区域性特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡虹	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	7	38	3.0	6.0
2	李伟	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	25	277	8.0	16.0
3	张志凯	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	7	38	4.0	6.0
4	王宇萌	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	3	2	1.0	1.0
5	贺金荣	中国疾病预防控制中心传染病预防控制所鼠疫室	5	30	3.0	5.0
6	张渝疆		1	2	1.0	1.0