不同植物无色花青素还原酶及其基因的生物信息学分析

• 作者: 李蒙 鲍锋
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 无色花青素还原酶 生物信息学 结构预测 功能分析
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 5-9
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 2973字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19386/j.cnki.jxnyxb.2017.09.02

摘要

对9种不同植物的无色花青素还原酶及其基因进行生物信息学分析,探索该蛋白的结构并预测LAR的功能.通过生物信息学软件对GenBank中已经登录的不同植物LAR基因和氨基酸序列进行分析,对其组成成分、理化性质、翻译后修饰位点、功能域、二级结构、亚细胞定位、分子进化等进行预测和推断.结果表明,9种植物无色花青素还原酶基因全长在1.0～1.2kb,编码342～391个氨基酸,不具有信号肽;9种植物LAR都具有蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和N-端肉豆蔻酰化位点,个别植物LAR具有N-端糖基化位点、酪氨酸激酶磷酸化位点和cAMP和cGMP依赖蛋白激酶磷酸化位点;二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主;进化分析表明禾本科的玉米与其他科植物亲缘关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲍锋	西安文理学院生物与环境工程学院	19	65	5.0	7.0
2	李蒙	西安文理学院生物与环境工程学院	8	12	3.0	3.0