鸭疫里氏杆菌porin基因的生物信息学分析

• 作者: 么乃全 张敏 徐凤宇 李新殿 李茂辉 高云航
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭疫里氏杆菌 微孔蛋白 克隆 生物信息学分析 二级结构 抗原性
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 兽医科学
• 页码范围: 176-177,180,295-296
• 页数: 1页
• 分类号: S855.1+2|Q78
• 语种: 中文

摘要

为了研究鸭疫里氏杆菌微孔蛋白(Porin)的结构与功能,试验采用PCR方法克隆了porin基因,并进行了生物信息学分析.结果表明:8种血清型的鸭疫里氏杆菌均在1 200 bp处获得目的片段,BLAST分析显示,8种血清型菌株的porin基因与ATCC 11845等菌株的同源性均达到100％;二级结构预测显示,Poirn蛋白前端存在3个α螺旋,为蛋白的信号肽部分,其余为β折叠和无规则卷曲;三级结构预测显示,Porin蛋白为8个β折叠所构成的圆桶结构,符合革兰氏阴性菌微孔蛋白的结构特点;抗原性分析显示,Porin蛋白的5个区段可能存在B细胞抗原表位.说明Poirn蛋白在鸭疫里氏杆菌菌株间具有高度同源性,且具有潜在B细胞抗原表位,Porin蛋白可用于鸭疫里氏杆菌的鉴定和疫苗的研发.