寨卡病毒全基因组进化及变异情况分析

• 作者: 何晓恩 余健海 刘旭玲 刘雨菁 吴清华 张宝 李凌 李盈 覃直然 赵卫 陆维智
• 来源期刊: 现代预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 寨卡病毒 全基因组 进化分析 变异
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 疾病预防控制
• 页码范围: 2264-2271
• 页数: 8页
• 分类号: R183.5
• 语种: 中文

摘要

目的 通过构建寨卡病毒基因进化树以及比较氨基酸序列差异,了解寨卡病毒进化及基因变异情况.方法 从GenBank获取1947年后各来源、各地区的寨卡病毒全基因组序列以及氨基酸序列,构建进化树并对氨基酸序列进行比较与分析.结果 寨卡病毒非洲型与亚洲型毒株可各自聚类,2007年之后分离的毒株均为亚洲型;2016年分离自中国的14株寨卡病毒均为亚洲型,同源性高达99.1％～ 100.0％,氨基酸变异位点11个.结论 寨卡病毒的分子进化与地理分布有密切的关系;2015-2016年分离的毒株同源性较高,序列较为保守;中国的14株毒株序列相近,其中1118、1875、2445以及26344个氨基酸位点可能对各自蛋白的结构和功能有较大的影响.