鹅VNN1基因的克隆及组织表达分析

• 作者: 周浩 姚文 李洁 郁建锋 顾志良
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鹅 VNN1基因 组织表达
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 140-146
• 页数: 7页
• 分类号: S835.2
• 字数: 4573字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201701006

摘要

[目的]Vanin是一种泛酰巯基乙胺酶,在脂类代谢中发挥重要作用.本试验目的是扩增鹅Vanin基因亚型(VNN1)基因的cDNA序列,检测VNN1基因在鹅不同组织中mRNA水平的表达规律.[方法]以太湖鹅(Anser anser)肝脏总RNA为模板,采用RT-PCR和快速扩增cDNA末端(RACE)方法克隆鹅VNN1基因全长cDNA序列,并运用多种生物信息学软件对其进行分析,应用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测VNN1基因在不同组织的表达情况.[结果]序列分析表明:鹅VNN1基因(GenBank登录号:KY399733)cDNA全长1924 bp,包含1476 bp的开放阅读框,35 bp的5′UTR和417 bp的3′UTR,共编码491个氨基酸.经预测鹅VNN1基因编码的蛋白质由7646个原子组成,相对分子质量为54870.61,理论等电点为5.23,是不稳定蛋白.在线预测发现鹅与鸭的VNN1蛋白三级结构呈现高度相似的螺旋和折叠.序列分析表明,鹅与绿头鸭的VNN1基因核苷酸及氨基酸同源性较高.系统进化树分析表明,鹅与绿头鸭亲缘关系较近.qPCR结果表明,鹅VNN1基因在肝脏的表达量显著高于小肠、肾、脾和肺(P<0.01).[结论]获得鹅VNN1基因的全长cDNA序列,该基因在肝脏中高表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚文	南京农业大学动物科技学院	81	1511	20.0	37.0
2	李洁	南京农业大学动物科技学院	12	119	6.0	10.0
4	顾志良	常熟理工学院生物与食品工程学院	65	234	8.0	12.0
5	郁建锋	常熟理工学院生物与食品工程学院	53	317	10.0	15.0
8	周浩	常熟理工学院生物与食品工程学院	1	2	1.0	1.0