甘肃黑猪H-FABP基因克隆、SNPs筛查及生物信息学分析

• 作者: 农伟伦 张丽 李宏旭 毕英杰
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘肃黑猪 H-FABP基因 SNPs 等位基因频率 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 378-385
• 页数: 8页
• 分类号: S828
• 字数: 6357字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2018.03.04

摘要

采用生物信息学方法从分子水平对甘肃黑猪H-FABP基因编码蛋白质的功能和性质进行分析.采用DNA池和直接测序技术对甘肃黑猪H-FABP基因进行SNPs快速筛查及其编码区蛋白质功能预测.结果表明,甘肃黑猪H-FABP基因编码区全长402 bp,编码133个氨基酸残基,共检测出4个SNPs,分别为C734T-Intron1、T152C-Exon2、G30A-Intron2、T121G-Intron2,其中 T152C-Exon2为错义突变,氨基酸由原来的异亮氨酸(Ile)转变为苏氨酸(Thr).生物信息学预测发现,甘肃黑猪H-FABP蛋白是一种稳定的亲水蛋白,蛋白质二三级结构均以β-折叠为主的混合型蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丽	西北民族大学生命科学与工程学院	53	105	5.0	6.0
2	李宏旭	西北民族大学生命科学与工程学院	4	4	2.0	2.0
3	毕英杰	西北民族大学生命科学与工程学院	8	9	2.0	2.0
4	农伟伦	西北民族大学生命科学与工程学院	3	6	2.0	2.0