马PPAR-γ基因序列生物信息学初步分析

• 作者: 姜兆兴 孙玉江 李静 芒来 萨如拉 陈建兴
• 来源期刊: 内蒙古农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 马 PPAR-γ 生物信息学分析 DNAMAN软件
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S821.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16853/j.cnki.1009-3575.2018.02.001

摘要

为阐明马PPAR-γ基因的结构及功能,采用DNAMAN软件对马的PPAR-γ基因序列进行初步的生物信息学研究分析.结果表明:完整的马PPAR-γ基因开放阅读框序列为1 584 bp,编码528个氨基酸,预测的马PPAR-γ分子量为60 KD,等电点为6.01.马PPAR-γ基因编码区使用次数最多的密码子是编码赖氨酸(K)的AAG(22次),密码子使用偏倚程度为0％-44％.马PPAR-γ氨基酸中以亮氨酸出现次数最多(54次),出现次数最少的为色氨酸(2次).马的PPAR-γ的二级结构以无规则卷曲为主,α螺旋和β折叠为辅.马的PPAR-γ多肽链的整体疏水性较弱,但在437-443处出现一典型疏水峰,在430-452氨基酸残基区域存在一典型的跨膜区.该研究结果为揭示PPAR-γ基因在马脂代谢中的作用奠定了基础.